Anvendelse af transaktionsværdi forudsætter, at visse betingelser er opfyldt. Når betingelserne ikke er opfyldt, skal toldværdien ansættes efter en af de sekundære metoder.
Se EUTK art. 74, stk. 1.
De sekundære metoder skal anvendes i den nævnte rækkefølge. Metode 3 og 4 kan dog anvendes i omvendt rækkefølge, hvis klareren anmoder herom.
Der er dermed en rangorden mellem bestemmelserne for fastsættelse af toldværdien, og det er altså kun, hvis toldværdien ikke kan fastsættes ved hjælp af en given bestemmelse, at man kan gå videre til den næste bestemmelse. Se Sag C-116/12, Christodoulou, præmis 43.
De sekundære metoder skal også anvendes, hvis toldmyndighederne ud fra begrundet tvivl ikke er overbevist om, at den angivne værdi svarer til det samlede beløb, der er betalt eller skal betales for de varer, som indgår i EUTK art. 70, stk. 1.
Se GF art. 140.
Eksempel
Domstolen har fx i sag C-291/15, EURO 2004, Hungary Kft. udtalt, at toldmyndighederne, når det skønnes, at den angivne transaktionsværdi sammenlignet med de statistisk gennemsnitlige købspriser, der gælder ved indførsel af lignende varer, er urimelig lav, kan fastsætte toldværdien efter en af de sekundære metoder.
Det følger af dommen, at toldmyndighederne med henblik på fastsættelse af toldværdien kan se bort fra den pris, der angives for de indførte varer og anvende sekundære metoder til toldværdiansættelse af indførte varer som fastsat i toldkodeksens artikel 30 og 31. Navnlig salgsprisen for lignende varer, hvis de stadig har begrundet tvivl vedrørende transaktionsværdien af disse varer, efter at de har anmodet om afgivelse af alle yderligere oplysninger eller fremlæggelse af alle yderligere dokumenter og efter at have givet den pågældende person en rimelig mulighed for at gøre sine synspunkter gældende vedrørende de grunde, som denne tvivl er baseret på. Se dommens præmis 35.