eIndkomst holder regnskab med brugen af frikort. Det sker ved, at eIndkomst to gange ugentligt, efter modtagelse af indberetning om A-indkomst, foretager en ajourføring af frikortsaldoen med det/de angivne beløb. Derefter dannes et nyt frikort med en ajourført frikortsaldo til elektronisk afhentning. Dette meddeles alle, der har abonnement på det pågældende eSkattekort/frikort.
Der må ikke samlet ydes større fradrag end den angivne frikortsaldo på det aktuelle eSkattekortløbenummer. Hverken pr. lønudbetaling eller samlet over flere udbetalinger. Muligheden kan opstå, hvis der fx laves flere lønberegninger uden der i mellemtiden er modtaget et nyt frikort.