Anvendelse af transaktionsværdi forudsætter, at visse betingelser er opfyldt. Når betingelserne ikke er opfyldt, skal toldværdien ansættes efter en af de sekundære metoder.
Se EUTK artikel 74, stk. 1.
De sekundære metoder skal anvendes i den nævnte rækkefølge. Metode 3 og 4 kan dog anvendes i omvendt rækkefølge, hvis klareren anmoder herom.
Der er således en rangorden mellem bestemmelserne for fastsættelse af toldværdien, og det er således kun, hvis toldværdien ikke kan fastsættes ved hjælp af en given bestemmelse, at man kan gå videre til den næste bestemmelse. Se Sag C-116/12, Christodoulou, præmis 43.
De sekundære metoder skal også anvendes, hvis toldmyndighederne ud fra begrundet tvivl ikke er overbevist om, at den angivne værdi svarer til det samlede beløb, der er betalt eller skal betales for varerne som indgår i EUTK artikel 70, stk. 1.
Se GF artikel 140. (Bestemmelsen svarer til den tidligere bestemmelse i GB artikel 181a).
Domstolen har fx i sag C-291/15, EURO 2004, Hungary Kft, udtalt, at når det skønnes, at den angivne transaktionsværdi sammenlignet med de statistisk gennemsnitlige købspriser, der gælder ved indførsel af lignende varer, er urimelig lav, kan toldmyndighederne fastsætte efter en af de sekundære metoder.
Dette var til trods for, at toldmyndigheden ikke havde afvist eller på anden måde rejser tvivl om fakturaens eller overførselsdokumentets ægthed, der var fremlagt som bevis for den pris, der faktisk var betalt for de indførte varer, og uden at importøren - som svar på toldmyndighedens anmodning herom - fremlagde yderligere beviser eller oplysninger for at godtgøre deres transaktionsværdi.